Appliquer la technologie CRISPR Cas9 en plantes - de la théorie à la pratique
Prochaine date : le 18/09/2025 - 5 jours - Montpellier (34) - Prix sur devis
Responsable de stage : Nicolas PONSERRE
06 65 50 64 84
nicolas.ponserre@semae.fr
Intervenant : Experts CIRAD
Objectifs, public concerné & prérequis
Objectifs
A l'issue de cette formation, les participants seront capables de :
- Concevoir intégralement une expérience de mutagénèse simple ou plus complexe (Base Editing, Prime Editing…) : choisir l'outil moléculaire approprié pour leur projet d'édition, réaliser le design in silico des cibles, adapter l'outil à son propre contexte scientifique et à sa plante
- Évaluer les problématiques liées à la mise en œuvre de la technologie CRISPR/Cas9 en fonction d'un contexte scientifique donné
- Génotyper des mutations obtenues sur plantes diploïdes
- Manipuler in silico des séquences nucléotidiques
- Connaitre les logiciels et sites en ligne utiles pour mener une expérience de A à Z
- Comprendre l'environnement CRISPR au sens large (promesses et points de polémiques)
Public concerné
-
Ingénieurs et techniciens de laboratoire
-
Scientifiques en biologie végétale souhaitant mettre en œuvre une expérience d'édition du génome dans leur laboratoire ou acquérir une connaissance complète, théorique et pratique
Prérequis
-
Posséder des notions de bases en biologie moléculaire (Bac+2 ou expérience professionnelle adaptée)
-
Maîtriser la langue française et avoir une bonne connaissance de l'environnement Windows.
Programme
- Technologie CRISPR-Cas9 :
- Introduction et mise en oeuvre
- Travaux Dirigés - les bases / les logiciels
- CRISPR
- Théorie du design et protocoles
- TD design
- La révolution CRISPR
- Amélioration variétale et édition du génome
- Législation et débat
- TD contruction de vecteurs in silico
- La codon optimisation / TD
- Introduction à la préparation de protoplastes
- Détection de mutation / TD
- CRISPR-based tools (outils dérivés de CRISPR)
- Edition à la base près (ou Base-editing) / TD
- Prime editing / TD
- Effets hors cible / limiter et détecter
- CRISPR - recherche médicale
Méthodes pédagogiques, évaluations et suivi
Méthodes pédagogiques
- Alternance d’apports théoriques et de travaux pratiques
- Quiz et exercices
Évaluation et suivi
-
Questionnaire de satisfaction
-
Evaluation des acquis en fin de formation
-
Attestation de formation
Informations pratiques
Dates :
- Module 1 : 18 et 19 septembre 2025
- Module 2 : 15, 16 et 17 Octobre 2025
Lieu : Campus de Lavalette - Avenue Agropolis - 34398 Montpellier Cedex 5
Labo CIRAD Montpellier - UMR Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes - Plateau d’Analyse Fonctionnelle et Edition des Génomes
Horaires (à titre indicatif, susceptibles d'être modifiés) : 08h30 - 16h30
Accueil : à partir de 08h15
Conseils pratiques :
Les candidats doivent apporter un ordinateur portable fonctionnel permettant une connexion wifi.
Attention, les logiciels utilisés ne peuvent pas être utilisés sur les Mac. Merci de prendre contact en amont avec les formateurs si vous ne pouvez vous munir d'un PC pour trouver une solution.
Pour rejoindre ce campus, deux possibilités de transport :
- Tramway ligne 1 (bleu) jusqu'à la station « Faculté des sciences et des lettres », puis Bus 22 ou La Navette (A/B) jusqu’à l’arrêt « Agropolis »
- Tramway ligne 1 (bleu) jusqu'à la station « Occitanie », puis Bus 23 ou 26 jusqu’à l’arrêt « Agropolis »