Sélection variétale assistée par marqueurs
Référence : 415
Periode : - Pas de date disponible actuellement - 4 jours - - 1890 €HT / pers.
Fiche formationIndisponible
Responsable de stage : Nicolas PONSERRE
06 65 50 64 84
nicolas.ponserre@semae.fr
Intervenant : INRAE
Objectifs, public concerné & prérequis
Objectifs
- Approfondir ses connaissances sur le marquage moléculaire, les différentes technologies utilisables et leurs applications dans les principaux schémas de sélection variétale
- Pouvoir mettre en pratique la cartographie et la sélection assistée par marqueurs
Public concerné
- Sélectionneurs et personnel de terrain
- Ingénieurs et techniciens de laboratoire
Prérequis
- La formation réf 105 « Comprendre les fondamentaux du marquage moléculaire » constitue une mise à niveau préalable pour les débutants, mais elle n’est pas indispensable pour les personnes ayant des bases en génétique ou en biologie moléculaire
- Réalisation d’un test d’évaluation en amont de la formation pour adapter le parcours
Programme
- Les différentes techniques de marquage moléculaire
- Notions de base sur le polymorphisme moléculaire
- Principes techniques pour cibler un locus et révéler du polymorphisme
- Génotypage Single Nucleotide Polymorphisms (SNP)
- Séquençage « nouvelle génération »
- Utilisation des marqueurs moléculaires pour gérer et valoriser des ressources génétiques
- Description et évaluation de la diversité au niveau moléculaire
- Structuration de la diversité dans les collections
- Marqueurs, phylogénie et phylogéographie
- Méthodologies de gestion de la diversité dans les collections.
- La cartographie génétique
- Principes, méthodes & population de carthographie
- TD / Démonstration : construction de cartes génétiques
- Cartographie et caractérisation de locus contrôlant la variation des caractères quantitatifs (QTL*)
- Détection de QTL dans des populations biparentales
- Modèle de détection, paramètres clés
- Extension au cas de populations multiparentales (NAM, MAGIC…)
- Sélection assistée par marqueurs pour des gènes majeurs et des QTL* : principes et quelques exemples
- Sélection assistée par marqueurs (SAM)
- Back-cross assistés par marqueurs (BCAM)
- Prédiction de la valeur génétique sur la base de résultats de détection de QTL (SRAM)
- Sélection génomique : principes et quelques exemples
- Introduction sur le principe de la sélection génomique
- Quelques modèles de prédiction
- Exemples d’application
- Perspectives offertes par les prédictions génomiques
- Génétique d’association : principe et quelques exemples
- Approches de génomique pour l’amélioration des plantes
- Approche gène candidat
- Recherche de colocalisations gène-QTL*
- Étude du transcriptome et du protéome
- Carte génétique et carte physique, clonage positionnel, séquençage génomique
- Travaux pratiques
- Estimation des distances génétiques à partir de données de ségrégation et construction de cartes génétiques
- Détection de QTL* (RQTL)
- Utilisation des QTL* en sélection (OptiMAS)
Méthodes pédagogiques, évaluations et suivi
Méthodes pédagogiques
- Alternance d’apports théoriques et d’animations interactives
- Analyses de situations
- Partages d’expériences
- Travaux pratiques
Évaluation et suivi
- Questionnaire de satisfaction
- Auto-évaluation de l’atteinte des objectifs pédagogiques
- Attestation de formation
Informations pratiques
Session : A3415A - du 14 au 17 novembre 2023 (4 jours)
Lieu : INRA - UMR de Génétique Végétale du Moulon - Ferme du Moulon - 91190 Gif Sur Yvette
Horaires (à titre indicatif, susceptibles d'être modifiés) : 09h00 - 17h30
Accueil : à partir de 08h45
Conseils pratiques : aucun
Plan d'accès et hébergements : en suivant ce lien