Sélection variétale assistée par marqueurs

Programme

• Les différentes techniques de marquage moléculaire
  • Notions de base sur le polymorphisme moléculaire
  • Principes techniques pour cibler un locus et révéler du polymorphisme
  • Génotypage Single Nucleotide Polymorphisms (SNP)
  •  Séquençage « nouvelle génération »

• Utilisation des marqueurs moléculaires pour gérer et valoriser des ressources génétiques
  • Description et évaluation de la diversité au niveau moléculaire
  • Structuration de la diversité dans les collections
  • Marqueurs, phylogénie et phylogéographie
  • Méthodologies de gestion de la diversité dans les collections.

• La cartographie génétique
  • Principes, méthodes & population de carthographie
  • TD / Démonstration : construction de cartes génétiques

• Cartographie et caractérisation de locus contrôlant la variation des caractères quantitatifs (QTL*)
  • Détection de QTL dans des populations biparentales
  • Modèle de détection, paramètres clés
  • Extension au cas de populations multiparentales (NAM, MAGIC…)

• Sélection assistée par marqueurs pour des gènes majeurs et des QTL* : principes et quelques exemples
  • Sélection assistée par marqueurs (SAM)
  • Back-cross assistés par marqueurs (BCAM)
  • Prédiction de la valeur génétique sur la base de résultats de détection de QTL (SRAM)

• Sélection génomique : principes et quelques exemples
  • Introduction sur le principe de la sélection génomique
  • Quelques modèles de prédiction
  • Exemples d’application
  • Perspectives offertes par les prédictions génomiques

• Génétique d’association : principe et quelques exemples

• Approches de génomique pour l’amélioration des plantes
  • Approche gène candidat
  • Recherche de colocalisations gène-QTL*
  • Étude du transcriptome et du protéome
  • Carte génétique et carte physique, clonage positionnel, séquençage génomique

• Travaux pratiques
  • Estimation des distances génétiques à partir de données de ségrégation et construction de cartes génétiques
  • Détection de QTL* (RQTL)
  • Utilisation des QTL* en sélection (OptiMAS)

Méthodes pédagogiques, évaluations et suivi

Méthodes pédagogiques

• Alternance d’apports théoriques et d’animations interactives
• Analyses de situations
• Partages d’expériences
• Travaux pratiques

Évaluation et suivi

• Questionnaire de satisfaction
• Auto-évaluation de l’atteinte des objectifs pédagogiques
• Attestation de formation

Informations pratiques

 Session : A3415A - du 14 au 17 novembre 2023 (4 jours)

Lieu : INRA - UMR de Génétique Végétale du Moulon - Ferme du Moulon -  91190 Gif Sur Yvette

Horaires (à titre indicatif, susceptibles d'être modifiés) : 09h00 - 17h30

Accueil : à partir de 08h45

Conseils pratiques : aucun

Plan d'accès et hébergements : en suivant ce lien